1984年7月，成立福州市计划生育协会。1992年7月，被列为市委管理的群众团体。

2003年5月，全市开展“捐款一次，惠及多人；母亲脱贫，全家幸福”主题捐款活动，募集善款1068872元。

2010年11月，省民政厅核准成立由福州市计生协发起的“福州市人口福利基金会”。

2011年3月，市委办印发市计生协“三定”方案，增加内设机构和人员编制。

2013年1月，印发《关于开展2013年“生育关怀行动”的方案》，把开展闽都助学、提供法律援助等十大项目列为生育关怀行动内容。

2016年8月，市委办、市政府办印发《关于加强新形势下计划生育协会工作的意见》的通知，对加强计生协工作提出新的具体要求。

2017年7月，市委批准成立市计生协党组。

2020年8月，《福州市计划生育协会改革方案》出台，明确计生协性质定位、职责任务、保障措施等。

2024年12月，市计生协召开成立40周年座谈会。