按照国家区域医疗中心合作共建协议，厦门市中医院将冠名“北京中医药大学东直门医院厦门医院”。今起将用5年时间，实现厦门市中医院与北京中医药大学东直门医院“品牌、技术、管理”三平移和“医疗规范、质量标准、教育培训”三统一，建立更加高效的符合中医药特点的体制机制，全面提升福建地区中医整体水平和核心竞争力，建成高水平的区域中医临床诊疗中心、高效率的区域中西医结合急危重症救治中心、高层次的区域中医人才培养基地、高水准的区域中医科研创新转化平台，引领提升区域内中医医疗、科研、教学及预防保健服务水平。同时，依托“互联网＋医疗健康”协作平台，打造特色突出、技术领先的专科联盟、专科集群。

未来5年内，厦门市中医院将新增床位编制数300张，达到1500张床位编制数。北京中医药大学东直门医院将安排一定数量的医护骨干常驻厦门工作，并选派专家担任重点建设发展科室的特聘主任或者学术主任。同时，北京中医药大学东直门医院标志性中医新技术、新方法、新材料将被引入厦门市中医院。厦门市中医院也将实现与北京中医药大学东直门医院信息一体化管理，建立完善患者转诊机制、检查检验结果互认体系，推动院内制剂的流通使用。