建院8年来，依托上海总院强大的综合实力，复旦儿科厦门医院（厦门市儿童医院）建立了名医工作室、特聘主任、学术主任和专科医师导师制共四个层次的学科建设与人才培养体系，专家常驻厦门指导工作。

医院共选送102名住院医师到总院接受住院医师规范化培训，选送12名规培结业医师接受专科医师规范化培训，其中已有90多位医师回院工作，成为医院各岗位的骨干力量。医院还分批选派各专业业务骨干350多人次到总院进修学习，不断提升医疗技术。医院海纳国内外儿科领域的20多名专家任学科带头人，技术力量雄厚。党委书记吴星东教授入选厦门市2021年本土领军人才支持计划，执行院长庄德义教授入选2020年享受国务院政府特殊津贴人员名单。