南平市人民医院妇科是国家临床重点专科（中医专业）建设单位、国家中管局“十二五”重点专科（中医妇科）建设单位、全国首批准予开展四级妇科内镜诊疗技术医院、福建省首家中医不孕症重点专科、福建省医疗“创双高”建设省级临床重点专科（中医类）建设项目，是南平市唯一一家开展夫精人工授精技术的单位；于2021年获得省科技厅区域发展项目《难治性不孕中医药多途径疗法的临床研究与推广应用》，实现南平市医学界在该项目上零的突破。

科室设妇科、产科，共设床位132张，妇科包括不孕症专科、生殖医学中心、普通妇科、妇科肿瘤及计划生育五个亚专科，目前开展子宫内膜异位症、多囊卵巢综合征、卵巢功能衰退、月经异常、围绝经期疾病、宫颈病变以及妇科肿瘤等中西医规范化诊治。专科研制17种院内制剂，使用率达98%，其中有七种进入医保报销范畴，让更多人用得上、用得起。