六年本科毕业后，肖定远大施拳脚的第一站在宁德市寿宁县犀溪乡，且扎根基层长达十年之久。

犀溪乡当时是闽东最偏僻的山区贫困乡，医疗条件十分落后。在医护人员严重缺乏的情况下，内科、外科、妇科、儿科、传染病，甚至产妇难产等，他都要顾及。只要病人求救，有诊必出，不论是要徒步两个多小时的山路，还是零下2℃的下雪天，他都不放弃对病人的治疗。

其间，他把祖传医业治验和大学所学的中西医理论相结合，边诊疗、边学习、边提高、边总结，挽救了许多人的生命，在当地颇受群众信赖。慢慢地，名声远播，吸引省内外病人慕名前来求医。

1977年，肖定远被调回福建医科大学，在中医系教授中医外科。1979年，福建中医学院复办，他回到福建中医学院中医外科教研室任教，还参加福建省人民医院中医外科创建及临床诊治工作。

多年来，肖老坚持在临床一线治病救人，即便是在任福建省第二人民医院副院长的近十年里，他也坚持每周三个半天出诊或参加病房查房、会诊。如今，他85岁高龄，仍坚持每周八个半天“高频次”门诊。